Для проведения этапа пробоподготовки – выделения ДНК из биоматериала – необходимы:
- набор реагентов для выделения ДНК (РНК) из клинического материала;
- настольная высокоскоростная микроцентрифуга (до 12 ООО об./мин);
- твердотельный термостат на 45–55°С;
- встряхиватель для микропробирок (типа микроцентрифуга -вортекс);
- комплект полуавтоматических микропипеток-дозаторов объемом 0,5-10, 5-40, 40-200 и 200–1000 мкл;
- водоструйный или вакуумный насос с колбой-ловушкой.
Рис. 14.3. Прибор "Термоциклер" для проведения полимеразной цепной реакции.
Для проведения реакции амплификации необходимы:
- "Набор реагентов для проведения ПЦР";
- программируемый термостат (амплификатор) (рис. 14.3).
Выбор модели амплификатора определяется конкретными задачами, стоящими перед диагностической лабораторией, ее возможностями и планируемым потоком анализов. Модели программируемых термостатов отличаются друг от друга количеством гнезд для пробирок, системой охлаждения (водяное или воздушное), объемом памяти при программировании, системой программирования, скоростью работы. Существуют одноплатформенные и многоплатформенные модели амплификаторов. Многоплатформенные модели позволяют проводить ПЦР по нескольким разным программам на всех платформах, что дает возможность анализировать пробы на наличие нескольких разных типов возбудителей одновременно.
Для регистрации результатов амплификации необходимы:
- источник постоянного тока и камера для электрофореза;
- СВЧ-печь или водяная баня на 95–100°С;
- комплект полуавтоматических микропипеток-дозаторов объемом 0,5–10, 5-40, 40-200 и 200–1000 мкл;
- диспенсер;
- ультрафиолетовый трансиллюминатор;
- ряд вспомогательных реактивов, не входящих в состав "Набора реагентов для обнаружения возбудителей инфекций методом ПЦР":
- агароза;
- 50-кратный ТАЕ-буфер для электрофореза (2М Трис-ацетат, рН 8,2, 0.05М ЭДТА);
- 6-кратный буфер с красителем для нанесения образца на агарозный гель (40 % сахароза, 0,25 % бромфеноловый синий);
- 1 % раствор бромида этидия.
Кроме того, для проведения анализов необходим ряд расходных материалов:
- стерильные пластиковые микропробирки объемом 1,5 мл для забора материала;
- стерильные пластиковые микропробирки объемом 0,5 мл для проведения реакции амплификации;
- стерильные пластиковые наконечники к микропипеткам;
- стерильные наконечники с фильтрами к микропипеткам;
- штативы для микропробирок;
- пластиковые шприцы к диспенсеру;
- одноразовые резиновые или латексные перчатки.